Już 1 lutego 2026 roku wejdą w życie przepisy, które nakładają na podatników obowiązek wystawiania faktur z użyciem Krajowego Systemu e-Faktur. Jeśli jest nałożony przepisami prawa obowiązek, to często w ślad za nim idą kary za niewywiązanie się z owego obowiązku. Nie inaczej jest w przypadku KSeF, gdzie przewidziano sankcje karne za konkretne czyny zabronione. Zgodnie z art.106ni ustawy o VAT wprowadzono trzy przypadki odpowiedzialności podatnika, który musi się liczyć z konsekwencjami jeśli wbrew obowiązkowi:

1. nie wystawił faktury ustrukturyzowanej z użyciem Krajowego Systemu e-Faktur;
2. w okresie trwania awarii Krajowego Systemu e-Faktur albo niedostępności Krajowego Systemu e-Faktur, albo w przypadku gdy podatnik nie ma możliwości wystawienia faktury ustrukturyzowanej z innego powodu niż awaria Krajowego Systemu e-Faktur, wystawił fakturę niezgodnie z udostępnionym wzorem;
3. nie przesłał w wymaganym terminie do Krajowego Systemu e-Faktur faktury, o której mowa w art. 106nda ust.1, art. 106nf ust. 1 lub art. 106nh ust. 1

Za powyższe przewinienia naczelnik urzędu skarbowego nakłada, w drodze decyzji, na podatnika karę pieniężną w wysokości do 100% kwoty podatku wykazanego na tej fakturze wystawionej poza Krajowym Systemem e-Faktur, a w przypadku faktury bez wykazanego podatku – karę pieniężną w wysokości do 18,7% kwoty należności ogółem wykazanej na tej fakturze wystawionej poza Krajowym Systemem e-Faktur.

Zaznaczyć należy, że mamy do czynienia tu wyłącznie z karą administracyjną, a nie wykroczeniem lub przestępstwem skarbowym. Zastosowanie w przypadku nakładana kar ma Dział IV Ordynacji podatkowej, a w sprawach nieuregulowanych stosuje się natomiast przepisy Kodeksu Postępowania Administracyjnego, w myśl których należy wziąć pod uwagę okoliczności, w których doszło do naruszenia prawa. W pewnych sytuacjach jak np.: działanie siły wyższej, możliwe jest odstąpienie od ukarania podatnika. Jeśli do nałożenia kary jednak dojdzie, to trzeba pamiętać, że będzie należało ją uregulować bez wezwania naczelnika urzędu skarbowego w terminie 14 dni od dnia doręczenia decyzji o ukaraniu. Na koniec wspomnieć trzeba, że wprowadzający wyżej wymienione czyny zabronione jak i kary za ich popełnienie art.106ni ustawy o podatku od towarów i usług wejdzie w życie dopiero 1 stycznia 2027 roku.